14.06.2021 – 14.48 – Il fisico Giovanni Bussi e il ricercatore Mattia Bernetti, entrambi impegnati presso la triestina SISSA, hanno scoperto un metodo per ottenere la struttura ad alta risoluzione di biomolecole nel loro ambiente fisiologico.
Allo stadio attuale la tecnica più utilizzata è quella della cristallografia a raggi X, in uso dai tempi della scoperta della doppia elica del DNA (1953); la molecola viene così ricostruita allo stadio solido, come se fosse un cristallo. Tuttavia le biomolecole in natura si trovano all’interno di ambienti ben diversi, solitamente acquosi: e una simile tecnica non ne restituisce la reale immagine che è dinamica, in continuo mutamento.
Il problema, che rimane un ostacolo non da poco per gli studi scientifici, è stato aggirato dai ricercatori della SISSA combinando dati acquisiti sperimentalmente con simulazioni al computer di dinamica molecolare. Nello specifico è stata utilizzata una tecnica di scattering dei raggi X a piccolo angolo, nota come SAXS, in sinergia con simulazioni via computer.
La sperimentazione è stata condotta specificatamente su un frammento di RNA coinvolto nella sintesi proteica, analizzando la sua dipendenza dai sali disciolti nella soluzione.
Invece di una singola struttura statica, “passiva”, l’esperimento ha rivelato due conformazioni molto diverse: una più compatta, e funzionale al processo di sintesi proteica, l’altra più estesa, a conferma della natura dinamica dell’RNA.
È evidente pertanto come la molecola cambi notevolmente a seconda che sia o meno presente nel suo ambiente naturale; una constatazione ovvia, ma alla quale si potrà ora dare risposta con un nuovo modello di analisi.
Uno studio che ha ricevuto l’imprimatur della scienza, perchè pubblicato proprio oggi sulla prestigiosa rivista accademica Nucleic Acids Research.
[z.s.]
